占领基尔库克的北华军很快就觉察到了英军轻易弃城逃离的意图：英国人表面上在开战初就丧失了北部三城里的第一个城市，但实际上却是把一个极度烫手的山芋塞入了北华军的手里。基尔库克拥有四十多万人口，清一色都是逊尼派居民，原先城内的什叶派居民都被英军在开战初给驱逐到了北华军占领区内，并且英军又从埃尔比勒、摩苏尔等其他地区迁移来了十多万逊尼派居民。北华军占领基尔库克，肯定要负责城内这四十多万居民的吃喝，而城内绝大部分的粮食储备早就被英军带去了埃尔比勒和摩苏尔，这样，给基尔库克居民提供粮食、饮水、被服、医药等生活物资就成了北华军新增的一大负担，这已经是非常令人头疼的问题了，而更加让北华军头疼的是，城内这四十多万居民都是对北华军、伊朗军充满误解和仇恨的逊尼派居民。“中国人和伊朗人这两伙异族异教徒是以消灭逊尼派为目的的”“他们已经在巴格达杀死了超过二十万逊尼派兄弟”“落入他们手里会必死无疑，他们马上就要对我们大开杀戒，基尔库克会成为第二个巴格达”，在英军添油加醋甚至是颠倒黑白的宣传下，基尔库克的四十多万逊尼派居民对这几点已是深信不疑。
在这件事上，北华军真的比窦娥还要冤。在巴格达杀人的明明是伊朗军，却被盟军宣传成了是北华军干的，并且巴格达逊尼派居民死难者大概是五万余人，而这个数字却又在盟军宣传机构嘴里翻了好几倍。中东地区的宗教问题本来就极度敏感，盟军刻意地抹黑北华军，让北华军百口莫辩，有苦难言。占领基尔库克后，赵海军考虑到防止伊朗军入城后又恶癖复发乱杀人，因此不允许伊朗军入城驻防，由北华军接管城市并负责重建社会秩序，协同防御基尔库克的伊朗军都留在城外驻扎。在入城部队的人数上，赵海军原打算动用两个团，一万余人。
“两个团太少了吧？”孙立人担心道，“城内可是有四十万逊尼派居民啊！并且我大致上还调查过，发现城内居民的青壮年比例非常高，超过一半都是十八岁以上、四十岁以下的青壮年，英军在撤离的时候说不定还留给他们不少武器，一旦这二十多万青壮年暴动起来，区区两个团怕是压不住。别忘了，我们想要进攻下一个城市埃尔比勒，从巴格达运输物资过来的军列是要经过基尔库克的铁路线的。后方若是不稳，前线必然动荡！”
唐飞虎提议道：“可否强行收缴城内居民的武器？”
戴安澜摇头道：“恐怕不行。城内居民对我们的敌意非常重，一旦我们强行收缴他们的武器，他们肯定会认为我们是即将对他们展开大屠杀而做准备，反而会提前刺激他们生事。”
唐飞虎气咻咻道：“哪有这样的事！我们给他们提供吃喝，却养着一群随时会在我们背后下黑手的暴民！”
杜聿明道：“如果我们增加在基尔库克的驻守兵力，那我们用于接下来进攻的力量就会被削弱了，这是不利于我们的。”
孙立人道：“可是，不确保后方稳固，我们怎么安心地放手继续进攻？基尔库克这四十多万逊尼派居民确实很棘手，我们不能杀，不能打，不能关，要给他们提供吃喝，又不能动用伊朗军来提防他们，甚至，我们也不能动用伊拉克人来提防他们，动用什叶派伊拉克人，搞不好又产生宗教仇杀，那我们更加是越抹越黑了，动用逊尼派伊拉克人，他们手里有了枪，对我们就更加不利了！”
将领们都很苦恼。确实，中东的情况实在太复杂了，北华军在这里都没办法组建傀儡伪军，组建逊尼派仆从军，会养虎为患，组建什叶派仆从军，就更加显得北华军在故意挑动宗教仇杀，而现成的伊朗军更加不能用，这让北华军不得不要亲自分派兵力去驻守后方。
“再加两个团，凑一个师。”赵海军只能从善如流，“两万人应该镇得住了吧？”
第120师奉命留下来联合五万余伊朗军共同驻守基尔库克，第101师和第106师则带着十多万伊朗军继续进攻，全军马不停蹄地继续向北，扑向一百多公里外的埃尔比勒。
又一场典型的沙漠城市攻防战在埃尔比勒爆发了。北华军因为占领基尔库克，因此分散了三分之一的兵力，同时后勤补给线也被进一步地拉长了，而英军因为放弃了基尔库克，因此反而收拢了防线，集中了兵力，使得双方的兵力比例此消彼长，自然而然，北华军此战的攻城难度被增加了很多。飞沙走石的荒漠城市周围，双方厮杀得天昏地暗。
比起激战中的埃尔比勒，已经被北华军占领的基尔库克城内，紧张气氛并不逊于埃尔比勒，留下来驻守这座城市的第120师在城内的浓重敌意中如临大敌，一名少校营长是这样叙述的：
“...这座城市还是不小的，起码算是中等规模，城区南北长三十多公里，东西宽十多公里，师部把全城划分为十二个区，每个区由一个步兵营负责，人数更多的伊朗军统统都赶到了城外，驻扎在郊区的荒地上。城市的气氛很古怪，我们都搞不清楚我们跟当地居民们究竟是什么关系，敌对吗？可我们还要保护他们，不允许伊朗军入城戕害他们，我们还要给他们提供粮食等物资，还不收缴他们手里的那些由英国人留给他们的武器弹药；军民一家吗？显然不是，我们跟居民们的关系十分紧张，虽然我们满怀友谊和善意，但他们的眼神却分明告诉我们，我们在他们眼里只是一群入侵者，甚至，连入侵者都不如，是更加邪恶的‘异教徒’，并且是欠下他们血债的异教徒。外国人、异族、侵略者、异教徒、杀死他们大批同宗教同派系兄弟的侩子手，这就是他们给我们贴上的标签。这座城市虽然已经被我们占领，但我们身在其中却感受不到作为征服者和占领者而应有的成就感，反而感到如履薄冰、战战栗栗，就好像猎人在一片黑暗的原始森林里，尽管手里有枪，但随时随地都有可能遭到危险。紧张的气氛笼罩全城，空气里都弥漫着刺鼻的火药味，我们很紧张，有多紧张呢？师座都不敢把他的师部设立在城内，而是放在郊区一个小村镇里，另外，我们全师化整为零地接管城市后，每天每夜都要派出小股部队进行巡逻，但巡逻部队的人数从来没有低于五十人，并且出门后都要配备无线电台或对讲机或信号弹等通讯设备，确保遭到袭击后能迅速求援，弟兄们结束巡逻后，即便是三五个人，都不敢一起出门，更别说一个人了，我们就好像生活在城市治安最差的城区里的小姑娘，天黑后都不敢单独出门。这很荒唐，但绝不是夸张。我多次有这种体会，当我带着一批弟兄们，荷枪实弹地走在城市的街道里时，街道两边的民房里，三五成群的逊尼派居民聚在一起，鸦雀无声，既没有交头接耳也没有高声谈笑，只是静静地看着我们，面无表情，眼神很冷淡地看着我们，目光很冰冷，充满敌意，我们身在其中的感受就不用说了，身边都是这样的居民，一小群、一小群地聚在一起，从不同的方向用冷淡的眼神看着我们，气氛十分压抑，弟兄们都子弹上膛，随时做好战斗准备，每个人的脸上都是努力克制出心头紧张而强装出的镇定，但额头上都在流汗，钢盔里的头发和贴身内衣都被汗水给浸透了。毋庸置疑，这些居民并不欢迎我们，说不定心里就在磨刀霍霍准备偷袭或暗算我们，而我们又不能开枪。弟兄们都很不满，因为我们一边要提防他们，一边还要保护他们，甚至还要给他们供吃供喝。我们在城内设立了很多救济站，分发当地居民愿意接受的面饼，还提供干净的饮水和医药。这些居民也不客气，每天排着队，面无表情地来领走食物饮水等物资，也不说谢谢，就好像我们欠他们，心里仍然充满敌意。很多弟兄都抱怨，说饿死他们算了，但上级军官是不允许的，因为我们在当地逊尼派居民心里的名声已经非常不好了，绝不能做出雪上加霜的事情。我的副营长冷笑着说，我们这种行为就是典型的热脸去贴冷屁股，吃力还不讨好。但我们还有什么更好的办法呢？
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骚乱一直都没有停，是骚乱，不是暴乱，也就是零零星星的武装袭击事件，大规模的武装反抗才是暴乱。这些居民手里有枪，我们是知道的，但我们不方便强制收缴。因此，骚乱隔三差五便发生，大多数都是在夜里发生的，基本上是针对巡逻部队，也有极少数是袭击我们的交通站、岗哨等机构。情况都差不多，一支我们的小规模巡逻部队在开进某条黑暗的小巷子里后，两边的楼上便突然冷不丁地呼啸出一串子弹，给我们不断地造成了零零散散但积少成多的伤亡。我们没办法对付这种袭扰性的偷袭，因为这些武装分子是暗中拥有枪的平民，拿起枪会打我们，丢掉枪就又变成了平民，并且周围的平民都是他们的眼线或共犯，不会告密，反而会帮助武装分子偷偷监视我们，这是苏联人的那种‘全民皆兵’模式，十分棘手，很难对付。我们艰难地忍受着这种局势，但有一次我险些就忍不住了。三连的一个排在一天夜里进行巡逻时遭到偷袭，死伤了十多个弟兄，排长带着剩余士兵扛着受伤士兵以及阵亡士兵的遗体，勉强杀出一条血路，结果发现有一个背着受伤弟兄的士兵掉队了，两个人都没有跟上来。排长急得两眼冒火，在出事地点周围搜寻了一整夜，但没有找到，结果第二天早上，那两个士兵被发现了，吊在一栋废弃的楼房上，死了，让我们悲愤至极的是，这两个士兵都是被斩首杀死的。两颗血淋淋的脑袋被挂在楼房窗口上，没有头的尸体被扔在地上。那个排的士兵们都险些崩溃了，排长红着眼睛在原地咆哮嘶吼道‘是谁干的？给老子站出来！偷偷摸摸算什么本事！’但周围居民都还是用那种冷淡的眼神看着我们，凶犯肯定就在他们中间，但我们却找不到，也不能展开报复。我当时怒火万丈，准备下令血洗出事点所在的城区，但团长阻止了我，要求我‘以大局为重’。我怒不可遏，我厉声问团长：‘我们自家的弟兄怎么办？那两个被砍头的弟兄怎么办？就让他们死得不明不白？我们怎么跟他们的家人交代？’
团长支支吾吾地道‘我们跟逊尼派的关系已经非常紧张了，绝不能火上浇油...’
我跳起来吼道‘那我们就要被他们杀？让他们杀得称心如意了，关系就好了？凭什么要用我们的鲜血来修复关系？我们连自家弟兄都不能保全，还要搞好跟这些异国人的关系？这是什么狗屁逻辑！’
团长哑口无言，但就是不允许我‘意气用事’。
但我不能让我的弟兄白死，哪怕丢了官，我也要给他们报仇。我命令部队封锁了出事点所在的城区，展开拉网式调查，还特地调来军犬搜寻凶器，结果在七户居民家里搜到带血的砍刀，以及几支英国的李恩菲尔德步枪和几百发子弹。我和弟兄们都咬牙切齿，我命令把这七户居民全部抓起来，共四十五个人，我通过翻译，要求他们自己交出凶手，但没有结果。愤怒之下，我命令全部枪毙，在行刑前，副营长问我，妇女和小孩怎么办？我当时想了想，命令妇女和十五岁以下的小孩可以免死，剩下的二十八个男子都押去枪毙，以此告慰我们那两个弟兄的亡魂。
团长获悉后十分恼火，把这事汇报给了师座，结果挨了师座一顿臭骂，被师座骂做‘迂腐’。实际上，这种事已经发生了好几起，也促使师座最终狠下决心，在全城展开全面的强行收缴居民手中武器的行动。结果彻底激化了我们和当地居民的矛盾，骚乱数量陡然间激增，规模也越来越大，超过一千的居民因为拒绝交出武器而被我们当场击毙。扪心而问，我们做的并没有错，但确实在客观上彻底让我们和当地居民水火不容了，最终爆发了全城大暴动。...”