景平元年九月二十日，福建总兵郑芝龙拥唐王朱聿键为帝，改年号为隆武。并在同一天，督水师战舰三百余艘，向台湾之钟建部发起攻击！
这消息顿时让群臣打乱。本以为随着李定国的溃败，中原大局已定，谁想到忽然又出了个什么隆武帝出来，难道这大明江山，又要重新乱了吗？
“不要乱，有武英王在，你们还怕什么？”
随着景平帝稚嫩的，但却充满了无比信心的声音响起，朱斌微微一笑：“多谢陛下信任，臣早料到郑芝龙海盗出身，与朝廷心怀二心，因此早有准备，我大明水师战场三百八十条由海上出发，刻日可以到达。又有大军三万，经陆路出发，向福建郑芝龙发起反击！”
见武英王镇定自若，早有准备，一众大臣的心这时才放了下来。不过也有不少人心里嘀咕，怎么郑芝龙总兵当得好好的，却突然弄了这么个事出来？那武英王又好像早就算计到了，莫非这一切都是朱由斌设计下的？
他们这次猜得倒是一点不错，郑芝龙之乱正是朱由斌一手安排的。
自景平帝登基，江南军屡战屡捷，中原鼎定，但很多地方势力却依旧在观望之中，看着朝廷新政，看着朝廷会对地方上采取什么样的措施。尤其是那些有军队的地方军阀，虽明里服从效忠朝廷，但却依仗武力，颇有些割据地方。暗里抗拒朝廷各项命令。
尤其是长久盘踞福建的郑家，早把福建视为了自己的王国。当朱斌出兵蜀地平定张献忠地时候，曾要求福建出兵出粮相助。但郑芝龙却仅发老弱残兵一千一应付。这让早就想解决郑家的武英王朱斌。终于下定了消灭地方军阀的决心！
自在郑芝龙地协助下，夺取台湾、澳门等地地钟建，便囤驻于两地，密切监视着郑家的动静。而黄溪又大量向福建安插情报人员，收买郑家部下。终于在京师沦陷之后，让郑芝龙有了拥戴一个皇帝，以控制朝廷的想法……
而他的目标，却很快放到了流亡到福建的唐王朱聿键地身上……
朱聿键，明太祖朱元璋第二十三子唐王朱柽的八世孙，于崇祯五年袭封唐王。李自成祸乱中原的时候，他向朝廷要求借兵三千前去参与镇压，朝廷怕藩王趁机叛乱夺位而予拒绝。
于是，他便自行在南阳招兵数千，亲自统领着寻找贼军作战。被打得大败。朝廷因他违反国法，降罪而废为庶人，囚居于凤阳。
福王在南京称帝后，将他释放，但又怕他争压帝位，命他迁居广西平乐府，但不久。朱聿键便流亡于福建。
送上门的朱聿键，让郑芝龙大喜过望。此时他拥有福建和巴达维亚两地。三年的发展，加上不断收拢各地大明的败军，让他已拥战船七百余条，军队八万余人，隐隐然成了继江南军之后大明的第二大军事集团。已经有了和朱斌叫板的资格。
尤其是在收复台湾和澳门的战斗中。江南军之伐罪军虽然展示了新式的战船，强大地武装。但其步兵却并没有拿出全部本事，也让郑芝龙产生了一份幻觉，认为江南军的力量不过如此，已经完全有实力和其较量……
在这样的心态驱使下，以及一旦成功所带来的巨大诱惑中，再加上部下的竭力怂恿，郑芝龙不顾反对的声音，和大明的安危，终于下定了另立新皇地居
他一方面积极备军，准备突击台湾和澳门两地，吃掉朱斌安插在自己身边的钉子。一边勾连荷兰人和佛郎机人，许诺以种种好处，要求他们地配合。
那荷兰人和佛郎机人，因为江南军收复失地的军事行动，而接连丢掉了台湾、澳门和巴达维亚三个地方，哪里肯定甘心，正一门心思想要着报仇。但本国和大明太远，又正在和西班牙争夺着海上利益，无暇分兵，因此只能把仇恨放在了心里。
可现在，这样的机会突然从天上掉了下来，他们虽然与郑芝龙一样有仇，但相比于江南军，和郑芝龙之间的那点摩擦，无疑要小了许多。
接受到郑芝龙联合出兵的请求之后，两国没有经过太多地犹豫，答应一起出战舰两百余条，士兵七千多人，与郑家水师合兵一处，一起参与攻击台湾澳门两地地军事行动！
而他们为此得到的好处，是郑芝龙将把台湾、澳门、巴达维亚三地交还给他们……
那朱聿键倒是坚决不想当什么皇帝，但在郑芝龙控制下地他，又哪里能够容得到他来做主？喜好读书，生活检点的这位唐王，便就这样被硬拉着当上了“皇帝”。
景平元年九月二十日，在朱聿键妄自称帝的这天，郑芝龙集郑家水师战场三百余条，荷兰、佛郎机战船三百余条，同时向台湾和澳门两地发起攻击。
但从三年前开始，在严密监视着郑芝龙动向的伐罪军，已用运送军粮等各种方式，秘密向台湾和澳门两地增兵，前后达到了一万余人，火炮六百余门，火枪八千多条。而钟建又在两地大力募兵，使得可用之兵在景平元年已经到达了两万六千人。
在郑芝龙的大举进犯开始之后，钟建和龙淄阁之水师各守其责。龙淄阁所部水师不与郑芝龙部交锋，而开始转而打击荷兰、佛郎机战舰。在击沉敌十余艘战舰，郑芝龙部增援上来的情况下，主动撤离战场，开始在外围寻找时机。