尽管朱翊钧高度重视，但能够造大型舰船的船工当时早已老死殆尽，大明造船经验严重不足。而且宝船虽大，但船速已经跟不上葡萄牙军舰航速——差距大概在一倍左右，也不符合朱翊钧要求。
因此，尽管当时负责督造的中官以各种手段从私营船厂中争夺“耆民”，也闹了些风波，但能够达到八节航速的船制造起来难度还是极大。
朱翊钧咬牙坚持投入，一直到万历五年俞大猷接手时，试制出来符合要求的大船不过二十余艘，其中最大的排水量不过五百吨。即便如此，在时人眼中，已经属于“巨舰”级别。
船有了，更重要的是培训海军，俞大猷受命所负责的，即是培训并摸索战法。从万历四年河漕改海开始，俞大猷就在朱翊钧支持下筹建海军。因其武将身份，朱翊钧恐其不能服众，当时加其后军都督府佥书，兼海漕护军总兵，指挥所设在登州。后来，在其卸任前又升他为左都督——算是退休待遇。
俞大猷虽然打过海战，但对手多数是倭寇的小船。这些年他和朱翊钧书信往来，朱翊结合新船提出的想法，都需要在海上演练并总结经验教训。
……
隆庆五年的时候，欧洲联合舰队跟奥斯曼舰队进行了勒潘多海战。此战欧人大规模使用了放置在船艏的火炮，取得了惊人的战果。
勒潘多海战之后，只有英国的军舰一条道走到黑，开始研究舷侧火炮，试图进行不接触作战。其余包括西班牙无敌舰队在内，全世界的战舰在火器的使用上仍局限船艏火炮，船员用火蒺藜和火绳枪，撞角和接舷战仍然是海战的主流。
幸运的是，本时空的大明有了穿越者。更加幸运的是，戚继光在嘉靖三十九年的时候，曾经组织发明了舰炮反后座装置，并将小型火炮应用在戚家军的海船之上。
当戚继光将舰炮反后坐装置报给朱翊钧的时候，朱翊钧的眼睛湿润了。尽管本时空戚继光已经得到了靖海伯的封爵，但朱翊钧知道自己给的远远不够——仅以戚继光的此项发明来说，就价值一个侯爵。[注2]
有了穿越者点破新的战术思想，又有了解决火炮反后坐的装置，“风帆战列舰”以及相应的战法的诞生就水到渠成。而万历九年罗马使团的到来，让大明的海军彻底插上了腾飞的翅膀——已经恢复了五六成手艺的大明船工，在学习了新型盖伦软帆船的制造技能后，大明的军舰也终于补上了最后一块短板。
此次凌云翼带着俞大猷到大沽，就是接收第一艘新型海军主力舰伏波号。这艘细长而又漂亮的三桅大帆船龙骨是船宽的三倍半，船艏又尖又长，前帆和主桅杆上面的主帆一样大，而且后桅杆上采用了三角帆。
三角帆的概念是朱翊钧提出来的，经过验证在大明新型舰船上被广泛采用。实际上，后世的非专业人士对欧洲时代的大帆船大多来自《加勒比海盗》：远远探出船艏的斜桅和吃满风三角帆。除此之外，朱翊钧知道的和俞大猷一样多。
但皇帝毕竟有他的看家手段——皇家格物院。格物院成立后，对于帆船理论研究也被提上了日程。他们研究的成果有三个：一是在船帆上增加了“帆骨”，使得此际大明舰船兼有硬帆和软帆的优点。另外一个成果是在桅杆上增加了多个桁架，把大船帆切成小块，这样在逆风的时候，经过复杂的操控，帆船仍旧可以保持一定的速度。
最重要的是，经过刻苦钻研，大明格物院终于将船舵放在了前甲板——变成了轮舵，并在罗马教廷带来的盖伦帆船制造技术中，找到了克服了大明福船船舵巨大这一缺点的制造工艺。
经过长时间的努力，伏波号终于定型，并将在大沽、临清、龙江等十个船厂同时开工建造。而第一艘试验舰和训练舰，将作为大明海军到日本宣旨的旗舰。
凌云翼——枢密副使兼海军都督，将率领大明粗具规模的第一个舰队，到日本传达皇帝对日本国王谵称天皇的愤怒。而在此之前，他要把俞大猷在武学中说研究的“风帆战列舰作战方法”全数掌握。