起初荷兰在台湾的驻兵并不多，只有二百六十人。因此还不敢乱作非为，对土著还比较收敛，公平交易，友好相处。但从1634年热兰遮城修好之后，巳达维亚向台湾增兵四百七十五人，实力大增的荷兰人也露出了殖民者的狰狞面目，开始对台湾的土著进行血腥征服，先后以武力征服了周边的麻豆社、虎尾垄社、萧垄社、加溜湾社等地，在五年的时间内，共计杀死土著四千余人，当奴隶贩买的有七千余人，烧毁土著的房屋八千余间、粮仓三千余间。
而且荷兰人不仅只接使用武力征服，还利用台湾各土著之间少有来往，釆用分化、挑拔等手段，挑起土著之间的内斗，打陇一方打击一方，以夷制夷。同时还派遣传教士到各土著的村社中去传教，并禁止土著信奉当地宗教，以实行精神控制。这些都是欧州殖民者的惯用手法。也给当地土著造成了极大的损失。
到这个时候，己有二百多个土著部落向荷兰人归服，人口约有四万五千余众。每年都要参加荷兰人在热兰遮城举办的集会，向侵略者交纳进贡。
近一两年来，荷兰人认识到台湾的自然环境良好，希望把台湾变成东印度公司在东亚地区的粮仓，因此引进了水稻和甘蔗进行大量种植。由于华人的种植技术远胜过当地土著，在一开始荷兰人还比较倚重华人。并从东南沿海招筹移民。
但随着华人的聚集和移民增加，荷兰人对华人的警惕也越来越大，一方面加强对华人的控制，禁止华人拥有武器，并且向华人收取沉重的税赋，另一方面强行分隔汉著，并在土著内部丑化华人，严禁华人进入土著的村社，授权土著逮捕进入土著区內的华人，并给予奖励等等。而在荷兰人的这种纵容政策之下，少数土著也公然抢夺华人的财产，抓捕华人。
总体来说，在荷兰人的控制下，华人的生存况状最差，其次才是土著。而且越是在靠近大员的地方，荷兰人的控制力度就越大，远离大员的地方，就要小些。
目前荷兰在台湾的最高官员被称为台湾大员长官。现任台湾大员长官名叫徳老典。本来荷兰人己经准备好了军队，打算趁着西班牙人在台湾守备空虚的时候，北上驱逐西班牙人，独霸台湾，但恰恰就在这个时候，西班牙远征舰队到达了台湾，也把德老典吓得不轻，赶忙向巴达维亚请救支援，但这时荷兰在东亚地区一共才只有三千多的兵力，巴达维亚也才一千多守军，他们同样也怕西班牙远征军进攻巴达维亚，那里能派得出援军来，德老典只好毎天诪告上帝保佑自己。
其实如果当时西班牙远征军真的要进台湾，这时早就占领了全台，但或许徳老典的祷告真的应验了，西班牙远征舰队并沒有攻取台湾，只在基隆驻扎了几天之后，扬帆远进，进攻中国本土去了。徳老典也松了一口气，但又担心西班牙人杀个回马枪来，也怕西班牙远征军真的征服了中国，或者用武力逼迫，独占了对中国的贸易。因此也是患得患失。
结果突然有一天，一艘中国的克戎船来到大员，船上的一位葡萄牙籍传教士带来了一位中国将军的信件，声称中国军队已经击败了西班牙远征军，并驱逐了台湾北部的西班牙人，现在要求荷兰驻台湾的最高官员进往基隆，去面前中国将军，商谈台湾归属问题。
当时德老典的第一反应就是不信，因为尽管荷兰在与郑芝龙的争夺中处于下风，但每次郑芝龙都要出动超过荷兰舰队数倍的战船，才能战胜荷兰舰队。因此在他看来，拥有六十多艘大帆船的西班牙远征军贵根本不可能被中国军队打败的。但经过了阿科尼亚的反复解释中国军队获胜的原因，总算是阿科尼亚是一位天主教士，德老典才算是有些半信半疑。
于是德老典立刻招集手下的军官商议，怎么样对待这件事件。军官们对西班牙远征舰队的失望是不信，但又想不出阿科尼亚骗自己有什么好处，最后德老典决定，派出两名上尉军官、林加和哈鲁斯，还有一名传教士尤纽斯跟着阿科尼亚一起去基隆，面见这位中国的将军，看看这葫芦里究竟是买的什么药。
而且德老典毕竟不是偏执的人，他也同样想过，如果阿科尼亚说的是真的，西班牙远征军真的失败了，那么也就可以看一看，荷兰是否有机会进攻台湾北部，独覇台湾，进而占领中国的浙江沿海地区，还可以侦察一下台北地区的地形和兵力分布，为以后出兵进攻台湾北部作好准备。
而退一步来说，如果中国军队真的有那么强大，那么一定是中国最强的军队，就不妨与他们协商合好，争取从他们那里取得贸易权，甚致还可以拉陇他们来打击郑芝龙。从而也可以扩大对中国的贸易。在这方面商毅看的一点也沒有看错，荷兰人的核心利益就是贸易。
因此林加、哈鲁斯、尤纽斯人带上了二十多名荷兰士兵，架驶着一条荷兰战船，随阿科尼亚出发，前进基隆。
在去基隆的路上，荷兰传教士尤纽斯也邀请阿科尼亚与自己乘坐同一条船，好互相交流一下在亚州传教的经验，实际上是想从阿科尼亚嘴里套一些话。虽然阿科尼亚是旧教，而尤纽斯是新教，但本质上都是天主教，而目阿科尼亚对新旧教义之争比较淡薄，毕竟是同行，因此也觉得亲近，于是就欣然同意。对尤纽斯的询问也尽量回答，只有对亚莉桑徳拉投降这件事情隐瞒了尤纽斯，当然这也是商毅特意咛嘱的。
虽然尤纽斯从阿科尼亚那里套来了许多话，但林加和哈鲁斯却怎样也不能相信，一个中国的将军，竟会使用欧州的战术，而且对欧州的历史和现况会有十分深刻的了解。但尤纽斯认为阿科尼亚也不像是在说谎话。几个人越琢磨越觉得难以理解，最后也只好决定，先不作判断，等到了基隆，一切就都清楚了。