就是浙江银行杭州总行刚刚挂牌成立，有消息传来，说是南京朝廷派遣黄宗羲为使，来到杭州，颁发对商家军在山东取得的胜利的嘉奖诏书。
商毅也不禁吃了一惊，这到不是说他没想到南京朝廷会对自己进行表彰奖励，立了这样大的功劳，而且弄得风声水响，怎么样也要给点奖励吧。但这次使臣的人选：黄宗羲到让商毅有些意外。
黄宗羲的大名，商毅当然是知道的，他是中国古代著名的思想家、经学家、史学家。和王夫之、顾炎武并称为明末三大宗师学者。是这三大宗师学者中年纪最大，而且也是唯一一个有着深厚东林背景的人。
不过在南明的南京朝廷时代，黄宗義的表现和其他东林党人并没有什么区别，视野狭碍，思想顽固，观念偏激，但却偏偏又自以为清高道徳，自以为事，眼高手低，不仅没有为南明朝廷做多少实质有用的工作，而且只顾內斗，不顾大局，使南明的力量在内耗中不断削弱。而在这方面，黄宗羲也可以算是东林党的一个典型代表人物。甚致可以说南明南京朝廷的短命，包括黄宗羲在内的东林党也有不可推缷的责任。
而且在南明灭亡之后，有一些学者也在反思东林党的行为，只有黄宗羲依然全力在为东林党辩护，他的观点是东林党都是正人君子，凡事与东林党作对，或意见不同，就是奸佞小人。而后世的学者往往出自对黄宗羲在学术思想上成就的尊重之情，只好对黄宗羲在这段时期的表现和政治观点避而不谈，有意忽略。
不过尽管黄宗羲在政治上的表现差强人意，甚致可以说是十分拙劣，但商毅也不否认，黄宗羲在思想、学术上的成就，确实达到中国古代最高境界，被称为宗师绝对一点也不过份。毕竟是人无完人，一个优秀的思想未必就是一个高明的政治家。这种显像也并不少见，在另一时空里的二百多年以后的那位康圣人，同样在思想成就上独树一帜，但在政治上的表现幼稚得连儿童都不如；还有比康圣人稍晚些时候的孙国父，虽然无愧于民主革命的先驱者，但在政治领域中，同样也是被晚清的老官僚们玩弄于股掌之间。
黄宗羲的政治理想主要集中在《明夷待访录》一书中，在中国古代，敢于骂皇帝不少，最知名的莫过于海瑞的那一份第下第一疏。而黄宗羲的最大成就就在于，他并非把予头对准历史上的某一位皇帝，而是从民本的立场来抨击整个君主制度。
有学者认为黄宗羲的思想仍属治权在君，并没有到达近代民主思想的标准，也有学者认为黄宗羲的思想是近代民主思想，在民权理论上还超越了欧洲的卢梭。但无论是那一点，在中国己经维持了数千年的君主制度社会中，能够提出“天下为主，君为客”的观念来，也是极其难能可贵的。
商毅在南京的时候，和黄宗羲到是见过一面，但两人并没有什么交流。黄宗羲只把商毅当做一般的武将存在，而商毅也不想和东林党多拉上关系。
商毅两次上报到南京的山东捷报，给南京朝廷造成了不小麻烦，因为现在南明朝廷中，无论是东林党还是马党都己经取得了一致的意见，决意与淸军议和。因此以马士英为首的一批官员但心商毅的行动会激怒清军，而拒绝与南京朝廷和谈。而吴甡却认为商家军在山东取得的胜利，可以让清军认识到南京朝廷还是有相当的实力，不可轻易战胜，对议和是有帮助的。
虽然两派的观点各异，但不管怎么说，商家军毕竞是取得胜利，而且还是对清军的胜利，当然应该给予嘉奖。不过商毅的官职爵位己经够高了，这一次也就只赏赐，不加级，但对在山东战场的几员商家军主将都给予加官晋爵。周少桓现在己经是副将，加授山东指挥使，童大勇现在是参将，加授山东指挥同知等等。而黄宗羲就是被派来宣告南京朝廷的封赏。同时还有封周世奇为浙江布政使、王夫之为浙江按察使的正式公文。
当然黄宗義还有一个使命，就是劝商毅悠着一点，別干得太过火了，万一真把清军给惹急了，也不好办。因为黄宗羲也也同意与清军暂时议和。
和左良玉、江北四镇这些军阀不同，在表面上，商毅对南京朝廷还是表现得相当尊敬。黄宗羲的官职并不高，但是朝廷的特使，也就相当于钦差大臣，而且又是著名的思想家，因此商毅也对黄宗羲做了十分隆重的欢迎。并且带着周世奇和王夫之在杭州城外迎接。
双方见面之后，商毅也主动上前施礼，笑道：“南雷先生，南京一别近两个月了，别来无恙吗？”黄宗羲在晚年号梨洲，但在年轻时号南雷，因此商毅也这样称呼他，以显得对他尊敬。
见商毅的态度客气，黄宗羲也不能据敖，他对商毅虽然不怎么待见，但也清楚现在东林的首要敌人是马士英，而商毅从一定意义上说，还可以算是东林党的盟友，因此拱手施礼，道：“商军门，久违了。”因为商毅是以武将出任巡抚，因此按惯例可以被尊称为军门。