当然放弃凤阳，退守扬州，也并不意味着就把凤阳到扬州之间的地方最都不设防，而且应该且战且走，逐步退却，不让清军产生怀疑，换句话说，实际就是要把清军慢慢诱到扬州来。另一方面也是为了其他部队和辎重的撒退，嬴得足够的时间，而这项任务由成进的第一师来完成。
而最后就是在淮西地区留下一支游动部队，在清军的后方活动，在外线作战，打击清军的补济线。这项任务，商毅交给了李定国的六团。同时又让段鹏带两个侦察营，加入李定国的队伍，组成外线作战兵团。也由李定国为主，段鹏为副，来指挥这支军队。
这个决定到是有些出人意料，因为李定国是中途加入商家军的，并不是山东的老部队，属于非嫡系出身。不过目前商毅手下的两支主力部队都有各自的任务，抽不开身，淮西一带河流密布，水网交错，也不利于骑兵大范围的高速移动，也只有六团这一支人马可派。而且在加入商家军之后，李定国一直都表现的不错，这次击败孔有德的香涧湖之战，就是他顶住了孔有徳的进攻，为其他部队的合围创造了机会，圆满的完成了任务，也充份显示出潜在名将素质。
另外现在的通讯手段并不发达，一但进入战场之后，部队的行动就由主将自己决定了，李定国是农民军出身，过去和明军交战都是边打边跑，也有一定的打运动战的实际经验。对商毅提出的运动战术理解的很快，可以说他确实是执行这顶任务的最合适人选。
安排好这一切之后，商毅这才率先返回扬州。当然也受到了史可法和扬州军民的热烈欢迎，
虽然南京朝廷没有把刘良佐和黄得功重新调回江北，但史可法也并没有感觉到太过担心，因为现在他对商毅己经完全相信了。虽然得知了商毅准备放弃淮西地区，并且对商毅提出的运动战术也是一知半解，但还是相信商毅这样做，一定是有道理的，因此也显得非常从容。
就在商毅回到扬州的第二天，史可法也招集扬州的所有官员，宣布将由商毅来主管整个江淮的军务，抵抗清军的南侵。
这时商家军新编的第五师剩下的两个团也己经到位，而且经过了兵工厂两个月的奋力抢工，武器也都装配齐全，也基本形成了战斗力，对于保卫扬州的战斗来说，这也是十分重要的。
另外李本深也把自己的部队拉到了扬州，接受了商家军的整编，经过了对士兵的考核之后，一万二千多人中兴有二千五百多人合格，商毅从杭州抽调一部份新兵，合并成了商家军第二十团，任命李本深为团长，让他们驻守淮安府，通过洪泽湖水路，支援泗州和盱眙的守军。并且又将不合格的士兵，连同家眷都送回杭州，接任全新的训练，而在剩余的士兵中，又有一千多人打算弃军务农，商毅也都满足了他们的要求，让杭州的行政官员安置他们。而这时商家军在江北战场的总兵力也己经达到了四万五千左右。
而在明军方面，刘肇基丢失了寿州之后，带着残兵也退回到扬州，史可法也任命他统管扬州的人马，这时在场州的明军，总计约有八千余人。同时史可法又命驻守泰州的江北四镇之一刘泽清，移驻高邮，和扬州形成犄角之势。
刘泽清是四镇之中兵力最薄弱的一个，手下只有三万余人，因此驻地也最偏，在江北的最东边，基本临近海边了。而且在驻守江北的这一年多的时间里，刘泽清到是很少闹事，但做的只有一件事情，就是拼命敛财。现在清军的东路军基本被打残了，黄河水道也被商家军的水军封锁，刘泽清守在泰州己经没有任何意义，史可法也想把这支人马利用起来。
其实早在商毅驻守淮河的时候，黄得功和刘良佐回援南京，史可法就想调刘泽淸去驻守庐州，抵抗清军，但当时刘泽清不敢和清军交战，死活赖在泰州不动。后来商毅在淮河大败清军，黄得功和刘良佐也江南大败左军，人人都立了战功，只有刘泽清什么也没捞着。
因此刘泽清也大为后悔，商家军战斗力强，打战很猛，自己可是早就知道的，怎么就没跟着去呢？跟着商家军身边，人家吃肉，自己也可以弄几口汤喝，总好过现在一事无成呀。于是史可法再下令调刘泽清驻守高邮的时候，刘泽清也二话没说，把人马全都拉来了。
这一样，明军的总兵力也差不多有接近十万，到是可以和清军有得一拼。也可以说，在商家军的带动下，各路明军也没有像另一时空里那样，纷纷归降清廷，现在的局势，远比历史上的要好。