就在商毅亲自赶到福建，帮助郑成功起兵抗清的时侯，湖北战区的李定国、李岩也向清军发动了进攻。这是商家军挺进大别山，开避湖北战区之后，首次主动向清军发动攻击。
这时李定国、李岩己经收到了消息，洪承畴和勒克徳浑回到了南京之后，立刻就开始从各地调集兵力，准备对湖北的商家军发动第四次清剿战争，而且这一次清军的规模，可能比以前那一次都大，预计总兵力将超过十万以上。
商毅去福建之前，统战部曾下令到湖北战区，正式成立第六军，由李定国任军长，黄庆文任副军长，李牟任参谋长，辖九师、十八师，三旅、二十二旅。
这时所有的部队也都己经整编完毕，总兵力约三万五千人，而各师旅的各级指挥官人选也由李定国，李岩上报到统战部得到了批准。另外还组织了民兵部队近六千余人。同时也得到了浙江送来的武器、弹药补充，各部队的武器装配都己经齐全了。还得到了一批**、霹雳火箭和一部份重型火炮，并且在第九师里正式编制了一个炮兵团，这也是第六军里唯一的一支炮兵部队。
现在整个黄州府只剩下黄州、蕲水县，蕲州三地还在清军的控制之下，而且这三地都是长江沿岸分布，清军也只能躲在城里，在城墙己外的地方，己经全部被商家军占领了，陆路的交通也完全断绝，三地清军的互相连系，只能通过水路来完成。
可以说现在湖北战区己经完全做好了战斗的准备。因此李定国、李岩也决定先发制人，在清军现在兵力还没有集结好的时候，首先出兵，占领黄州府全境，然后再迎击后面清军的进攻。
商家军首先攻取的目标是蕲水县，因为蕲水正好位于黄州和蕲州之间，先取下蕲水县，也可以彻底断绝黄州、蕲州之间的联系，然后再对黄州、蕲州实行逐个击破。
这次进攻蕲水县，李定国决定由三旅、二十二旅，付责主攻，十八师付责阻击黄州、蕲州的援军，如果这两地派出援军的话，而九师留守麻城县。因为蕲水是一个县城，清军守卫的兵力并不多，相对也好打一些，因此出动的都是新编制的部队，也是让新兵增加一些战斗经验，以后才好应付更困难的战斗。
而这时清军在黄州府地区的防守重点是黄州，其次是蕲州，蕲水县根本就不在考虑的范围内，守卫蕲水县的，只是当地的一些降军，只不过是因为蕲水县正好位于黄州、蕲州之间，而这段时间以来，商家军又忙着修整扩编恢复工作，才让清军一直控制着蕲水县，其实在尚善心里，早就己经把蕲水县放弃了。
果然李定国带领着部队杀到蕲水县之后，首先在城下进行火力压制，随后派出突击部队进行攻城，而清军只是稍做抵抗，很快就任鸟兽散，商家军十分轻易就攻入了蕲水县，有不少士兵甚致连一枪都没有放而黄州、蕲州也没有派来任何援军，这个结果也让李定国有些郁闷，因为这一战对新兵基本没有多少的煅炼价值，只能算是着来打了一趟酱油。
不过又夺下了一座县城，总算也是好事，接下来，就是黄州、蕲州两地。李定国也立刻招集军部和各师、旅级军官，开会商议讨论，先打那一处。
现在己经基本侦察清楚了清军的兵力分布，蕲州大约有八千多兵力驻守，并有少量火枪、火炮。因此攻打蕲州，显然也难度不大，但蕲州位于黄州府东南一带，地历位置比较遍远，并不是什么战略要地。而黄州是黄州府的治所之地，而且也正好位于黄州府的中心位置，地理位置好，但黄州也是清军重点防守的城市，守军兵力约有二万七千余人，而且还有大量的火炮、火枪，因此攻取黄州的难度也要大得多。
但在会议上，第六军的大部份将领都倾向于先打黄州。因为一但打下了黄州，把第六军的指挥部移到黄州来，对于指挥布置整个黄州府地区的战斗，迎击清军的大队人马，当然是十分便利的。而且黄州一破，蕲州还不就是手到擒来了吗。尽管黄州的守备兵力雄厚，但都是清军第三次进攻湖北失利之后的败军，对第六军来说，不过就是自己的手下败将，因此也都觉得没有什么了不起的。
见几乎所有将领都主张先打黄州，李定国也觉得没有什么不妥，在他看来先打黄州还是先打蕲州，区别也不大，反正都是要打的，因此也就这样决定下来。并且向杭州统战部发出了己收复蕲水县，并且准备进攻黄州的报告。
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商毅回到杭州的时间是八月二十七日，而在浙江地区，跨海突袭舰队这时己经做好了全部的准备工作，并且定于八月三十曰，从杭州出发，进行这次最为关建，也是变数最大的任务。因此商毅只在杭州休息了一夜，然后立刻赶刻海军基地，参加舰队出航的送行。