洪承畴当然也知道，清廷不可能把所有的新军全都交给自己统领，能给自己留下一个营的人马，就己经很不错了。在北京动乱发生之后，洪承畴率兵进京，等动乱暂时平息了下来之后，洪承畴驻军在密云县，维持北京周边地区的治安。对于北京內部对于这次动乱善后的争论，洪承畴心里虽然清楚，应以安抚为主，不可再施行强硬手段，但他同样也清楚，这不是自己应该参与的事情，因此对此也一声不吭。
不过对于逃到密云县的北京百姓，洪承畴还是尽量安抚，并使他们在密云地区安置下来，并给他们提供粮食和住所，差不多等于是建立了一个难民营，到了后来，差不多收容了约有七八万百姓。
等清廷正式下旨，赦免百姓，让百姓重新返回北京之后，洪承畴也立刻将这一批百姓，全部都遣返回北京，并如实向清廷报告了自巳收容难民的事情。
当然在清廷做出安抚百姓的决定之后，洪承畴的这些工作也受到清廷的大加赞扬，密云到北京还不到一天的路程，因此就在第二天，清廷的嘉奖圣旨也发了下来，加封洪承畴为一等阿达哈哈番，并招他入京面对。
洪承畴当然知道，这个时候招自己进京，绝不会是只为嘉奖自己安抚百姓的工作，恐怕也是战事的需要。在动乱发生之后，洪承畴同样也估计到了，中华军一定不好错过这个机会，乘机向清廷发动进攻，因此洪承畴在这段时间里，除了安抚百姓之外，也对目前南北的局势作了一番细仔的研索，做足了准备工作。
接到了多尔衮的传召之后，洪承畴立刻进宫，面见多尔衮。等进宫之后，洪承畴发现，多尔衮双眼深陷，面色憔悴，虽然头发不多，但也竟有些花白，也可以想像，这次动乱，给他带来了多大的压力。
等洪承畴见完礼之后，多尔衮也没有什么客气话，直接就道：“老洪，现在的情况你也清楚，你认为商毅会不会趁机来打我们？”
洪承畴道：“回禀摄政王，以臣看来，商毅必会发兵，来进犯我大清。”
多尔衮也点了点头，这一点也早在他的预料中，又道：“那么你认为，商毅会从那里开始发动进攻呢？我们又应该如何抵御呢？”
洪承畴道：“回禀摄政王，臣以为，商毅近年连续发动两场海外战争，恐怕在一二年内，无力全面进犯，因此这次进军，必会选择一二个地点，发动攻击，但俱体会从何处进攻，实在难以预料，因此当传旨边境各军，必须严加防守，不得怠慢，静观其变。”
甴于清廷的情报网络受损，这大半年的时间里，对南京的情况掌握得并不是很清楚，只能按一般的常识来判断，这两年时间里，南京连续发动两场海外战争，虽然都取得了胜利，但自身也一定会受到相当的消耗，就算兵力损失不大，但钱粮物资一定消耗了不少，不可能在第三年就马上向清廷发动全面的进攻。因此多尔衮也稍稍有些安心，又道：“老洪，你认为在边境地区，还有没有必要再増加一些兵力呢？现在京师一带，还是有一些兵力的。”
洪承畴摇了摇头，道：“臣以为暂时不必，现在边境各处的兵力，自保应是有余，不用来多加人马。大军一但调动，商毅必有警觉，因此也会避实击虚，何况就算是给边境各地增加一两万兵力，也不过是杯水车薪，用处不大，因此不如集结兵力，静观其变，等找准了商毅的进攻方向之后，再作决定。”
顿了一顿，洪承畴又道：“何况现在北京动乱刚刚平复下来，人心尚未安定，难免不会有人趁机举乱，集众闹事，因此京师重地，不可不留重兵驻守，以备不测之需，京师之兵，不可轻动。另外朝廷可以派人说动吴三桂、尚可喜，让他们两人从商毅的侧后方发动进攻，以牵制商毅的兵力。”
多尔衮也点了点头，这也正是他所担心的，北京动乱虽然是被平息下来，但满汉之间的矛盾却仍然十分尖锐，北京的局势是控制住了，但很难说其他的地方会不会出事，清廷入关才五年的时间，基础并不是十分稳定，人心也没有安服，由其是在南京向北方发动进攻的时候，难保在清廷內部没有人会举事影应，因此确实要保留相当的兵力，一但发生新的暴乱，就必须以最快的速度镇压，以免蔓挻开来。洪承畴果然还是老成持重，
另一方面，现在确实是让吴三桂、尚可喜他们发挥作用的时侯了，现在的清廷己经很难独立对抗商毅，不说是清廷灭亡，或者算是元气大伤，对吴三桂、尚可喜来说，也都不是好事，可不能让他们再袖手傍观了，在必要的时侯，甚致可以出让一些实际的利益，也要让他们出兵相助。因此多尔衮也道：“老洪，还是你想得周全。”
这时洪承畴又道：“商毅无论向南阳、徐州、济南何处进攻，都尚不足为虑，臣唯一担心的，还是他会从海上打过来。”