另外他下旨，派出一支三万人的部队，由孟飞率领开入到蒙古草原之中，进驻到前些年毁于战火的归化城一带，重新筑城，将原来的归化城扩建，成为一座大型的城池，由大中军驻守，并且派出官员，在这里对整个蒙古诸部行使管理，以后蒙古诸部的区域，将会设立蒙古行省，省府就设在归化城。
对于蒙古一带的管辖问题，于孝天决定一步步的来，下一步他准备大批朝蒙古一带移民，开荒种地，逐步的增加关外蒙古一带的汉人数量，然后逐步建立起蒙古行省，并且逐步建起更多的城池，通过这些城池，以点带面，逐步的全面控制住蒙古诸部，最终完成将其彻底控制。
至于蒙古诸部高兴不高兴，愿意不愿意，这就不是他管的事情了，现在他手头兵强马壮，谁不听话对不起，先断你们的互市权，接着召集蒙古各部随军助战，将其讨灭，这会儿大中的军力极为旺盛，当然不容他们翻起多大的浪花。
另外对于皇宫之中，于孝天下旨禁止继续阉割的制度，停止增招太监，原来的太监进行分流安置，将其逐步迁出京师回乡安置养老，仅留下了极少量的太监在宫中留用，至于原来大明皇宫之中的宫女，也尽数遣散回乡安置，将他原来在福建那边府中一批丫鬟调入宫中。
这么一来，整个皇宫仅剩下了不足百人的太监宫女，远远低于前朝宫中太监宫女的数量，使得皇宫里面顿时变得清清冷冷了下来，这么多宫殿根本就用不完，于孝天于是下旨将大部分空闲的宫殿全部都封存起来，包括各种以前宫中的物品也封存到了宫殿之中，没有他的旨意，不得启封。
他仅留下了少量的宫殿，供他和家人以及那些宫女太监居住，并且让宫女们在宫中服务到二十岁之后，便可以离开宫中寻找一个婆家嫁出去，至于那些留下的太监，以后等他们老了之后，另行进行妥善安置，彻底终绝中国历史上畸形的太监制度，而且现在留用的太监，也不再干涉任何政务，违旨者严惩不贷。
接着就在奉天元年秋天的时候，于孝天又干了一件让天下读书人瞠目的事情，就是他力主改革在中国已经推行了上千年的科举制度。
在经过和官员们之间反复的争论以及博弈之后，于孝天推出了新的科举制度，虽然继续保留科举制度，但是在原来科举制度上，大副削减了八股文在科举考试之中所占的比重，同时对于诗词歌赋等方面的考核也不再给予很高的重视。
但是在原来科举考试之中，增设了一些全新的科目，其中对于策问之中经义方面的学问也进行了大副削减，不再以经义作为策问的主题，而是大副提高了策问之中关于政事方面的学问，以此为策问的主题。
而策问主要涵盖了经济、民生、吏治、行政、管理、农业、水利等方面的问题，另外增加了工商业方面的一些问题，提出各种问题，让应试的生员对这些实政方面的各种问题，提出他们的见解以及他们的对策，更多的考核学子们对于实务方面的能力，而不再过度关注他们对于墨义、贴经、经义、诗赋等方面的造诣，写的一手好文章，以后就不见得能获得好成绩，但是如果在时论和实务方面，有交好的表现的话，以后将会在科举之中获得交好的成绩。
这就倒逼着以后的读书人，不得不放弃以前读死书，死记烂背的那种做学问的方式，而是逼迫着他们必须睁开眼，多关注各种实务方面的学问，关注更多有关民生、经济、工商业等方面的学问，更重视为官的实际工作能力。
另外在策问之外，还增加了数算方面的考核，想要当官可以，但是在数学方面，就必须也要有所造诣才行，就算是不要求太高，起码的一些有关数算方面的学问，是必须要学的东西。
这也算是一种变相的妥协，暂时还要照顾一下以前那些读书人，起码不能完全站在读书人的对立面，治国方面，现在于孝天还离不开这些旧式的读书人，必须要给他们留下一条晋身的途径才行，否则的话以后恐怕他很难找到足够多的人来给他办事，这也算是任何一个朝代的当权者，都要面临的一个问题，所以最终于孝天才在这方面进行了妥协。
当然于孝天还在科举制度之外，另外增设了一种全新的考试方式，那就是在各部之下，设立了一种新的考试制度，称之为专业考试。
有些读书人以前不是诗赋经义学的不好吗？但是在某些方面却业有所专，但是这种人却基本上无缘能中举，也就无法踏上仕途，充其量只能给当官的充当小吏，管一些事情罢了。
但是现在好了，给你们开一条新路，你们不是业有所专吗？这也可以，只要业有所专学有所成，在某些方面具有较强的专业技能，那么就可以到各部之下，去参加专业考试。
这些专业考试不考诗经之类的东西，只考核各种专业方面的学问。
吏部之下设立的考核项目，主要是行政管理，对于精通管理的人员，可以选择到参加吏部的考试，如果确实在行政管理方面有很不错的能力的话，而且还在各种有关实务方面有独到的见解，可以判定在这方面学识突出，那么好了，就可以录用，以后可以到地方官府之中任职，稍低一些，但是也是一个晋身的途径。