1831年至1840年间，巴西帝国由三人摄政委员会理政，包括已回国的若泽·博尼法西奥·德·安德拉达。以辅佐年幼的佩德罗二世。在这几年间，巴西境内开始出现不同的骚动及暴乱，如1832年在东北部的帕拉伊巴省及伯南布哥省就出现了示威的浪潮。其后数年，国内的形势更加纷乱。1834年，安德拉达独自摄政。但无法控制各省的混乱事件，因此，国家放宽各省自治权，令中央政府的权威大幅削减。
破衫汉战争在摄政委员会执政的年代，国内出现骚乱根本是屡见不鲜的事情。当中比较著名的有1835年1月，帕拉首府贝伦（belém）出现大规模暴动，政府军派出军舰镇压。九个月后，在南部的南里奥格兰德首府阿雷格里港中爆发叛乱，领导者成功取得城市的控制权，反对帝制统治。打算建立一个行联邦制的共和政体。政府军只好再派军队到当地扫荡，展开为期十年的“破衫汉战争”（guerradosfarrapos）。翌年。南里奥格兰德脱离巴西独立，建立共和国。另外，在1837年，巴伊亚首府萨尔瓦多亦出现******教黑人起义，欲建立一个巴伊亚人的独立国家。再加上1839年马腊尼昂的市民起义，都令政府军措手不及。然而，这些动荡不安显示出各省对祖国的不满及对立，这个现象更一直延续到下一个世纪。
即使政府对各省的叛乱加以镇压，但政府却无力进一步加强对各省的控制。为了挽回局势，在1840年间，帝国议会漠视摄政委员会的休会法令，再次召开议会，并咨询小佩德罗登基的意愿。其后，小佩德罗同意登基，并于次年7月18日即位，恢复皇帝的统治，以回复国家的统一、和平及繁荣。
佩德罗二世统治时期（1840年－1889年）
佩德罗二世登基后，立刻废除联邦制度，再次建立中央集权的政府，加强对各省的控制。起初的几年间，共和主义者反对帝
制，再次发起暴动，但很快就被镇压下去。不久后，佩德罗加速集权，他运用宪法赋予的权力，解散自由派占多数的下院，并重新甄选出保守派的议员，以压制自由派的势力。此外，他又赦免各省叛乱者的刑罚，但同时把他们驱逐出境，解决国内的反对声音。
1850年，巴西进行土地改革，推行新的土地法，取缔以往非法占据的土地，并制定土地买卖的限额。同年，佩德罗二世开始着手废除在在巴西几百年之久的奴隶制度。在英国及本土部分人士的施压下，巴西政府首先宣布非洲奴隶的买卖为非法行径。不久后，英国对这个借口感到厌烦，便宣布奴隶买卖的行径与海盗无异，并派战舰到巴西海岸袭击这些奴隶运输船。在英国的武力干预下，巴西政府只好驱逐当地的葡萄牙奴隶贩子，并要求各省长官加以取缔。其后，更禁止外国向巴西输入奴隶。最后一艘的奴隶走私船自1855年后到达巴西后，巴西的奴隶买卖完全中止。
其后，巴西开始加强本土咖啡产业的发展，并加速进行工业化。在1871年至1880年间，本土的咖啡出口占总出口量的六成，比以往三十年增加一成之多。此外，巴西的棉花、烟草、可可豆、橡胶及巴拉圭冬青也是重要的出口产品。直至今天，巴西仍然是部分作物的主要出口国，也是奠基于此时的发展。随着巴西咖啡产业的急速增长，吸引了英国投资者的到来进行投资。在19世纪下半叶，巴西的铁道、航运及道路网开始加速发展，能够快捷方便的进出沿海及内陆，为巴西的运输网络带来正面影响。亦因如此，巴西的工业得以发展，加速巴西的工业化。
随着1864年爆发巴拉圭战争，巴西在战争中得以加速军需工业的发展。战争为巴西带来了宝贵的作战经验，亦令巴西军队得以进行现代化。不过，巴西在这场战争中亦付出很大的人命代价，换来的是巴拉圭的领土。此外，战争亦加强了道路网的建设及部分产业的发展，亦使得巴西开始走向现代化。当时欧洲的不稳局势为巴西带来欧洲的新移民，亦有助于巴西的发展。
1870年代以后，废奴主义的呼声愈来愈大。1879年，主张废奴的人士开展了废奴运动，各省议员随即开展了省议会，投票表
决废奴运动。1883年，“废奴联盟”成立，废奴运动蔓延全国。次年，六十五岁以上的奴隶得到解放，各省纷纷宣告废除奴隶的宣言。1888年5月，身处欧洲的佩德罗二世支援女儿伊莎贝拉公主签署废奴法令。5月13日，议会表决“黄金法”（lei?urea），宣告废除奴隶制度，而巴西奴隶制终于在此时走向灭亡。
但是，自废奴运动后，共和派人士也希望能够打倒帝政，实现共和，令共和主义的呼声高涨。1887年，军官德奥多罗·达·丰塞卡组织军事俱乐部，开始策划政变。1889年11月15日，德奥多罗·达·丰塞卡与另一位军官弗洛里亚诺·阿劳霍·佩绍托联合共和派人士发动军事政变，成功包围内阁会议厅，抢夺政府控制权。丰塞卡宣告废除帝政，改行共和制，建立临时政府，而本来支持帝政的农场主及地主却因为佩德罗二世支持废奴制度而倒戈。两日后，佩德罗二世逃亡至法国，巴西帝国正式瓦解。
巴西帝国为实行君主立宪制的资本主义国家：
两院制议会，分上院（贵族院）和下院（众议院）。(未完待续。)