随着问题逐一得到解决，太平洋战场上下一阶段作战行动的大概方案也确定了下来，随即，聂人凤亲自主持了几个重大会议，将任务落实到了各个部队上。作为甘永兴的主要助手，谈仁皓参加了大部分的会议。与他预料的并不完全一样，在确定具体的战役任务的时候，校长还根据实际情况做出了细节上的调整。
第四特混舰队仍然被继续留在了中太平洋战场上，黄晓天也得到了正式任命，在西南太平洋上出现重大转折之前，只有第四特混舰队在中太平洋上迎战美军第五舰队。而黄晓天的首要任务是确保能够坚持到八月底，而在此之前，第四特混舰队将尽量避免与第五舰队决战。廖汉翔作为太平洋战区司令官，全力配合与支持第四特混舰队。
在会议期间，聂人凤与甘永兴都单独找过黄晓天，向黄晓天阐述了第四特混舰队的任务重点。与谈仁皓所说的一样，第四特混舰队的主要任务就是在中太平洋上尽量多坚持一段时间，迫使美军把第五舰队留在中太平洋上，而不是派往西南太平洋。为了达到这个目的，仅仅只有第四特混舰队是不够的。因此，廖汉翔也有很重要的任务。即在攻打澳洲的时候，廖汉翔必须要在中太平洋上摆出进攻的姿态，对夏威夷群岛东部的重要岛屿构成直接威胁，以此迫使美军将第五舰队留下。
相关的战役部署是，第四特混舰队将在中太平洋战场上自由活动，机动巡逻海域从中途岛到马里亚纳群岛，而具体的行动将由黄晓天自行确定。廖汉翔则在加德纳岛，莱桑岛加强陆战队的部署，同时加强对考爱岛等岛屿的轰炸，登陆舰队将在中途岛集结，而为陆战队提供作战物资的运输船队则留在阿普拉港。这只是进攻态势，而不是真正的进攻，只有在澳洲大陆上的战斗取得了决定性的胜利之后，廖汉翔才能够启动攻打夏威夷群岛东部岛屿的作战行动。
整个战役的重点仍然在西南太平洋上，颜国忠仍然负责进攻澳洲大陆的总体指挥工作，雷少卿为战区舰队司令官，袁野为陆战队司令官，古迅雷为陆军参战部队司令官，其他的司令官也得到了确认。最为重要的就是雷少卿的职权范围。
在登陆阶段的作战行动中，雷少卿所负责的舰队指挥工作是相当有限的，各特混舰队仍然由舰队司令官指挥，而雷少卿能够直接指挥的只有得到了加强的西南太平洋战区舰队，而该舰队的主要任务就是为陆战队提供直接火力支援，是除陆战队登陆舰队所配属的火力支援船队之外，能够为陆战队提供直接火力支援的唯一部队。另外，雷少卿还将负责调配各特混舰队的行动，协调舰队与其他部队的行动，负责安排特混舰队的补给工作等等。也就是说，在很大的程度上，雷少卿实际上只是各特混舰队的后勤保障司令官，对特混舰队的行动没有直接指挥权。
在当时，这个安排也是比较合理的。特混舰队仍然是帝国海军的主力作战部队，在指挥体系没有调整过来之前，战区舰队司令官的权力如果太大的话，反而会影响到特混舰队的作战行动。另外，雷少卿在后方也无法指挥特混舰队，这个事实必须得承认，而由他来调配各特混舰队的作战行动，实际上就已经给了他足够巨大的权力了。从指挥体系上看，雷少卿的地位已经得到了承认，在整个作战行动中，是由他来指挥特混舰队的司令官，并且负责协助特混舰队的作战行动，而不是由特混舰队的司令官向他发号施令。仅此一点，就让雷少卿有了足够巨大的权力。
舰队的编制也做了一定的调整。第一特混舰队，第二特混舰队与第五特混舰队都被增强为三航母特混舰队，这是当时的指挥系统下最强大的编制了，而且三支特混舰队的护航战舰都是按照最大程度编制的，除了第二特混舰队暂时无单独的炮击编队之外，第一特混舰队与第五特混舰队都有单独的炮击编队。
第三特混舰队的变化是最大的，原先计划在第三特混舰队返回后被派往南大西洋战区的四艘战列舰以及配套的巡洋舰，驱逐舰都被留了下来。这些战舰除了部分巡洋舰被编入了第一特混舰队与第五特混舰队的炮击编队之外，其他的全都临时编入了第三特混舰队，由常荐新负责指挥。而第三特混舰队是当时最强大的炮击编队，而其主要任务就是在近距离上为陆战队提供炮火支援。
战区舰队的编制也发生了变化，原本隶属于太平洋战区的战区舰队被派到了西南太平洋战场上来，与西南太平洋战区舰队合编为一支舰队，该舰队里的六艘小型航母被分成了两个独立的航母战斗群，在作战中，该舰队的任务仍然是为陆战队提供支援，而两个小型航母战斗群将轮番上阵，以保证能够持续不断的为陆战队提供支持。
陆战队的登陆舰队也做了相应的调整，最大的变化是，刚刚服役的那批新建造的护航航母将全部编入陆战队登陆舰队的火力支援舰群里面，而且配属了直接隶属于陆战队指挥的航空兵（之前，陆战队并无单独的航空兵）。而该舰群除了为陆战队提供支持之外，还有一个重要任务，那就是在必要的时候，承担起为特混舰队以及战区舰队运送作战飞机的任务。
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地面作战部队方面，陆战队与陆军作战部队都做了相应的调整。
颜国忠组织了至少30个陆战师，而这些陆战师的任务是负责登陆，夺取登陆场，并且巩固登陆场。也就是说，在登陆作战中，陆战队将承担起所有的任务，陆军参战部队并不参加登陆作战，而是在陆战队上岸，并且建立起了登陆场之后，陆军参战部队才会踏上澳洲大陆，顶替陆战队，负责发动大规模进攻。
这30个陆战师被编为了陆战队第一集团军群，由袁野少将（已经确定将会晋升为中将）担任司令官。而该集团军群又被编成了“甲”，“乙”，“丙”三个集团军，其中“甲”集团军有8个陆战师，其中有6个主力陆战师，其任务为负责抢滩登陆，并且在随后的行动中拓展登陆场，掩护其他部队上岸。“乙”集团军编有12个陆战师，其中有4个主力陆战师，主要任务是承担第二轮进攻行动，打通几个登陆场之间的联系，拓展登陆场的纵深，在陆军参战部队上岸之前，负责向美军防线纵深发动进攻。“丙”集团军编有10个陆战师，其中有4个主力陆战师，这是整个战役的预备队，如果前期作战顺利的话，“丙”集团军将在随后的作战行动中与陆军参战部队配合，一起攻打悉尼港。而“丙”集团军的编制并不固定，在作战时，可以根据实际的情况，从另外两个集团军中抽调部分部队进行加强，以增强其进攻能力。
在整个作战安排中，古迅雷指挥的陆军参战部队是地面进攻的主力部队。而在会议中，古迅雷已经做出了保证，在六月中旬的时候，他手下的两个坦克师，以及新编制的炮兵师都将完成训练与整编工作，而且将在地面作战中发挥最重要的作用。
从整个登陆战役计划来看，陆军参战部队的任务比重大概占到了一半，而且其主要任务就是在上岸后夺取悉尼，为后继部队，以及运输船队提供理想的上岸地点。实际上，夺取悉尼是整个澳洲战役的分水岭，在此之前为登陆作战阶段，而只要夺取了悉尼，那么就将进入到地面作战阶段。
最初，颜国忠并没有计划让陆军参战部队在此之前上岸，认为陆战队有足够的能力打下悉尼，可在确定具体的战役计划时，颜国忠做出了让步。当时，已经有迹象表明，美军正在加强悉尼的防御，虽然增派到悉尼的美军并不是很多，美军的主力仍然留在了布里斯班，但是随着悉尼防御力量的增强，如果仅凭陆战队的力量攻打悉尼的话，恐怕就得花上更多的时间了。另外，为了将美军第五舰队牵制在中太平洋上，廖汉翔需要更多的陆战队在前线摆出进攻的态势来，因此不得不将原本应该用到西南太平洋战场上的10个陆战师投入到了中太平洋战场上去，这更迫使颜国忠考虑让陆军来承担起进攻悉尼的重任了。