纽约城市重新恢复了宁静，然而，四只勇敢的忍者神龟——拉斐尔、米开朗基罗、唐尼和莱昂纳多，以及他们的智者导师斯普林特老鼠，深知在这充满了超自然威胁的世界中，新的危机可能随时降临。
站在屋顶上，温暖的阳光洒落在他们身上，他们的目光中闪烁着坚定和决心。
“我们已经面对过那么多威胁，每次都能战胜它们。”莱昂纳多说道。
“没错，不管是忍者巨龟还是坏龟，我们总是能够找到解决方法。”唐尼补充道。
拉斐尔握紧手中的武器，目光坚决：“我们必须保持警惕，随时应对新的威胁。”
突然，一只巨大的苍蝇飞来，引起了他们的注意。但这只苍蝇并不寻常，它散发着奇特的能量波动。
“这不是一只普通的苍蝇。”米开朗基罗皱起了眉头。
突然，苍蝇的身体爆发出能量，转变成了一个人形的形态。在他们眼前，一个陌生的男子出现了。
“你们就是忍者神龟吗？”陌生男子冷笑着说道。
“你是谁？”莱昂纳多警惕地问。
男子迈步走近，目光中闪烁着奇异的光芒：“我是苍蝇博士斯托克曼，你们可以称呼我斯托克曼。”
斯托克曼，一个新的威胁突然出现。他似乎能够将自己变形成其他生物的形态，使得他在战斗中变得异常棘手。
“我们不认识你，但如果你想挑衅，我们可不会手软！”拉斐尔警告道。
斯托克曼勾起讥讽的笑容：“很好，我正需要一些强大的对手来验证一下我的实力。”
紧接着，战斗爆发。忍者神龟们与斯托克曼展开激烈对决。斯托克曼的变形能力使他时隐时现，仿佛化身为苍蝇，又似乎变成其他动物，使得他难以捉摸。
然而，经过多次合作，忍者神龟们建立了默契。他们紧密协作，充分发挥各自的武术技能和元素力量，试图找出斯托克曼的弱点。
在战斗中，他们渐渐发现斯托克曼的变形并不是无限的，每次变形都会耗费他的能量，使得他的能力逐渐减弱。
拉斐尔突然想到一个战术，他大声喊道：“集中攻击，不要给他变形的机会！”
忍者神龟们立即行动，紧密合作，不给斯托克曼片刻喘息的机会。斯普林特老鼠则站在一旁，不
时给予他们指导。
终于，他们的努力奏效了。他们成功地将斯托克曼逼到了墙角，使他无法继续变形。
“我不可能被你们这些乌龟打败！”斯托克曼咆哮道。
“这正是团队的力量。”莱昂纳多说道。
随着斯托克曼逐渐虚弱，最终他再也无法维持变形状态，现出了真实身形。
“我们不是来找麻烦的，但我们会坚决捍卫这个城市。”唐尼说道。
斯托克曼怒气冲冲地向下水道逃去，最终消失在黑暗中。