湘军水师将武昌城外的太平军战船焚毁殆尽。
太平军没有水师，没有战船，断难守卫武昌。石凤魁将武昌城外的太平军全部撤入城内，准备弃守武昌。
10月14日，石凤魁派军出城反攻洪山，堵击湘军塔齐布部，又留数百人在武昌城西南方向摇旗放炮，佯装坚守城池。
太平军军主力轻弃城池，自城东门冲出，沿长江东岸向大冶、兴国方向急撤。
同日，太平军汉阳守将、殿左三十九指挥古隆贤率军撤出汉阳。
石凤魁贪生怕死，抢先撤退。他一走，太平军秩序大乱，争相溃逃。
令人不耻的是，石凤魁只顾着自己逃命，忘了通知汉口的水师。
汉口汉水中还有上千条辎重船，都被湘军瓮中捉鳖，纵火焚烧！
10月15日，汉阳汉口两地的西征军乘坐残余战船，顺流东下。湘军水师不依不饶，严密阻击西征军败兵。
西征军损失惨重，只得在汉口登陆，经长江北岸撤往湖北黄州。
武汉三镇原为西征军在两湖的基地，太平军在此集聚了大量的水师战船。经此一役，太平军水师大船折损大半，黄州以西再无一只太平军战船。
湘军夺下武汉镇，咸丰帝龙颜大悦，将署理湖广总督杨霈改为实授。对于立下首功的曾国藩，咸丰赏其两品顶戴，署理湖北巡抚。
然而，咸丰担心曾国藩尾大不掉，很快便收回成命，改授曾国藩兵部侍郎衔。
总督、巡抚为地方主官，权力极大。湘军并非正规军，军饷、粮草都要靠自筹。
数万大军，每天吃喝都是一笔极大的费用。曾国藩虽是团练大臣，并无实际权力，地方督抚完全不买曾国藩的账。
曾国藩要筹措军饷，只能在各地建立厘金局，擅自在地方上设卡收税，侵夺地方财权。
这样一来，曾国藩难免要得罪地方大员。各地战事急时，积极供应湘军粮草，战事缓和下来，就翻脸不认人。
曾国藩屡受其苦，早就盼着做个督抚。若能荣膺湖北巡抚，湘军粮草军饷难题将大大缓解。
咸丰以皇帝之尊，出尔反尔。个中微妙，曾国藩一清二楚，却也满肚苦水无处倒。
湘军攻下武昌，留在武汉附近休整兵马，清剿太平军残敌。
却说太平军这边，石凤魁、黄再兴率武昌败军来到田家镇，与林启荣合军一处，企图固守田家镇，戴罪立功。
10月23日，石凤魁急向安庆方面的石达开求救，请求派出援兵，接济粮草弹药。
石达开正在皖北督战，安庆由罗大纲驻守。罗大纲回函，要石凤魁“坚耐自守，教导士兵”，又称秦日纲正在湖口。
秦日纲则严谕石凤魁严守田家镇，自己亲自率兵进援田家镇。
一到田家镇，秦日纲立马开始着手完善田家镇江防。石凤魁是武昌战败的罪魁祸首，秦日纲将其撤职，严加看守。
这在石达开看来，秦日纲未免有些落井下石。两人之间的裂隙进一步扩大。
不久，杨秀清诰谕秦日纲，要秦日纲全面主持田家镇战事，又将石凤魁拘拿回京，大刑伺候。
杨秀清对田家镇之战非常重视，除了命令秦日纲死守田家镇，还从各地调来精兵强将，把豫王胡以晄、佐天侯陈承镕都调到田家助防。
对于田家镇的防御，杨秀清自有高见。他派涂镇兴押解一座大木簰到田家镇，要秦日纲模仿制作。
为防止湘军破坏铁链，杨秀清指示秦日纲在长江中横设铁链，在铁链下排列小船，使用铁锚固定小船。如此一来，即便湘军烧断铁链，铁链其余部分也将雄峙江上。
秦日纲深知田家镇的重要性，不敢怠慢，日夜赶造防御工事。
11月3日，秦日纲在田家镇召开军事会议，传达杨秀清指示，部署机宜。参加田家镇会议的有林启荣、陈玉成、李秀成、张子朋、侯裕宽、涂镇兴、曾传凤等太平军大将。