在复兴会治下，政府依托左七军建立，故称为军政府。随着复兴会占领区的扩大，随着战事规模的扩大，军政府逐渐暴露出了不少问题。
例如，依托左七军组建军政府，很多左七军军官得以在军政府兼职，权势更大，大量资源向左七军倾斜。
作为水师的右二军，经费需求更大，作战风险更大，军官们却缺少在地方政府任职的机会，在资源占有上不如左七军。
再如，左七军官兵在军政府兼职，遇有战事，官兵难以迅速出征。官兵出征后，一些重要岗位出现空缺，又会影响政府职能，甚至使某些部门瘫痪。
因此，南昌之战一结束，吴捷便开始在江西全境推行军政分离。具体来说，就是左七军退出地方政府，让专业的人干专业的事。
从此之后，江西军政府改称江西省政府。省政府实行省-市-县-乡四级政制。市一级大概相当于满清时期的府、州，管辖若干个县。
左七军则把全部精力集中到练兵备战上。
军队纪律性强，军政府自然会忠诚于复兴会。左七军退出地方政府后，如何保证复兴会对政府的领导呢？
吴捷的对策是在各级成立复兴委员会，成员由五至九人组成，统一领导辖区党、政、军、工、学、农等各类事务。
委员会设主任一人，成员通常有政府行政长官、驻军首长、工商联主任、法院院长、咨议局局长等。
咨议局是地方立法机构，负责对复兴会制定的法律进行细化、完善，对政府提出施政建议，督促政府官员廉洁奉公。
驻军首长方面，内陆地区一般由左七军方面担任，沿江沿湖地区可增补一名右二军首长。
江西省政府设在南昌，江西省复兴委员会也设在南昌。复兴委员会主任为复兴会的第二号人物、左七军复兴委员邹世安。
正是夏天上午十时，难得是个阴天，天气并不十分火热。
邹世安等人在赣江码头边等候已久。自5月以来，江西全境很少下雨。本该是丰水期的赣江，却像枯水期一样，江面狭窄，两岸裸露出干涸的河床。
此处码头距离南昌西门最近，仅有三四百米距离。因为水陆两便，这里一直都是处繁华的地方。南昌之战时，吴捷特意避开这处地方，选择在城西北方向攻城，百姓至今感念他的恩德。
虽然赣江水位变浅，江上的行船却更加忙碌。码头附近亦聚集了不少粮船。
因长江流域大旱，中兴公司以北美钢铁子公司所炼钢铁为交换，从北美进口了二十万吨粮食。粮食漂洋过海，运费不菲。
吴捷留给上海、天京、皖南各一万吨粮食，剩下十七万吨粮食全部运抵江江西。
上海的一万吨粮食交给上海支部霍恩，以争取上海士绅、洋人的好感。天京的一万吨粮食直接送给东王杨秀清。皖南的一万吨粮食一半留给驻守此地的太平军罗大纲。
满清只允许洋船在通商的五座城市驻泊。来自北美的粮船只能在上海停船，由中兴公司方面派船接收粮食，再分发至各地。
南昌是个重要的集散地，故赣江码头边聚集了不少粮船。执委会粮食部遵照吴捷指示，着手建设粮食储备制度。他们在码头附近建有粮仓，平时有警察驻守。
因吴捷要造访南昌，邹世安等人已经驱散了码头附近的闲人。十时半，两艘汽轮准时抵达。邹世安看了眼身后的江西大员、南昌士绅，提醒大家振奋精神。
出乎大家意料的是，吴捷带着妻子、女儿走在了前列。复兴会一贯主张男女平等，鼓励妇女出来工作。但妇女在体力、集体生活、战斗方面存在诸多弱点，男女平等难以有效落到实处。
那些南昌士绅从小受到理学、封建礼教的熏染，对女人在外面抛头露面十分反感。
吴捷是复兴会长，他们自然不敢说什么，心里却甚是不以为然。他们低头查看李雲的脚，果然像传说中的那样是个大脚。
大脚女人，在外抛头露面，与洋人有何不同？难道吴捷真的不在意？难道他真的要以夷变夏？
满清方面也在攻击复兴会，极尽污蔑之能事。其中传播最广者，就是攻击复兴会要以夷变夏。
他们认为，吴捷重用洋人，引进机器，建设电报网，会破坏华夏龙脉、风水。久而久之，龙气委泄，地脉隔断，华夏也将变得和洋人一样，野蛮不知诗书礼仪。