虽说马尼拉湾的面积，可比当年的大员安平湾大得多，海湾纵深足有五十里，两岸的炮台都没法够到海湾中间的海域。
但是，一直被围在中间，郑成功也要担心夜间被敌人小型炮舰逼近偷袭，还要担心躲避到外海的西班牙主力舰队随时回来偷袭。郑成功决定还是不要分散兵力，逐步进攻各个击破比较好。
于是明军暂时撤出马尼拉湾东侧半部海域，集中夹攻作为海湾外侧屏障的巴丹半岛和科雷吉多岛。
明军舰队收缩了阵地后，在巴丹半岛西岸重新建立滩头阵地，扎营把攻城炮运到岸上。经过几天的短暂准备，差不多就可以强攻了。
期间西班牙人倒也有尝试派出小规模敢死队，趁夜摸黑来偷袭明军攻城炮兵营地，但都被巡夜的明军痛击歼灭了。
与此同时，刘国轩的部队，也打通了北部一百余里的陆上通道，把从林加延湾到巴丹半岛的占领区连成一片。占领区内聚拢的逃亡汉人也越来越多，虽然带来了些粮食，却因为这些汉人百姓同样要吃饭，一时口粮有些紧张起来。
郑成功就吩咐部队分兵去找当地跟汉人有矛盾的土着征粮，让汉人百姓带路。凡是敢于反抗的，那就直接杀光——当然，郑成功严格交代了，只允许从那些此前“协助西班牙人杀汉人”的有仇的土着部族开始下手。
安排完持久战的军需问题后，郑成功向刘国轩打听，西班牙人的兵力构成。
刘国轩已经上岸多日，也从本地汉人那里打听到了翔实情报，就一五一十告知：“这些佛郎机人往年常年有两千余人至三千五百人的驻军在马尼拉，此地已经被他们经营百年，非常重视。
前些年这些佛郎机人屠戮我汉人子民后，唯恐大明报复，屡次请求本国增兵，此后每年增兵一千五百左右，至今已增了两轮了。如今马尼拉和巴丹半岛、科雷吉多岛三处要塞，共计有佛郎机真夷六千五百人，关键是还纠集了仇视汉人的土着兵数万。
当地土着懒惰，屡屡仇视福建、潮汕来的汉人比他们勤恳，善于聚敛家财，他们便心生歹意，每每劫掠汉人。佛郎机人深知其中民情，多年来利用土人的懒惰贪财，挑唆他们对付汉人，其中一些部族，就是靠搜刮勒索汉人致富，成了佛郎机的统治帮凶，根本不可能争取。”
郑成功闻言，脸色冷厉：“那还有什么好争取的，敢跟佛郎机人一起对付我汉人的，杀尽便是！听说土人多分属不同部族，少有往来，我们盯着几个部族灭，也不至于得罪所有人。
假以时日，其他部族自然不敢胡乱仇恨。六千五百真夷，数万土人，不足为惧！”
郑成功很清楚，西班牙人不可能跟所有的土着关系都很好，他们只是需要一些打手部族，够他们压制住汉人就行。因为西班牙人不是来做慈善的，他们可不会好心到抢擅长经商的汉人、却善待土着，土着同样是西班牙人的剥削压榨对象。
其实同一时期，欧洲殖民者在西非搞奴隶贸易也是一样的，他们会拉拢一些黑人土着部族当打手抓俘虏，然后问他们低价买俘虏，就省得白人亲自去抓了。西班牙人拉拢的菲律宾土着，就相当于“帮着抓其他黑人当奴隶”的打手部落。
干掉他们，完全不用担心陷入全民战争的汪洋大海，反而是替天行道吊民伐罪了。
……
十一月上旬剩下这几天，郑成功便在巴丹半岛登陆场做好了攻城部署。明军因地制宜稍稍挖了一些外围的火炮掩体坑道，但并没有挖得离炮台太近。
毕竟明军此番的攻城火炮都是从海路运来的，而海路最适合运输重型装备，所以携带的攻城臼炮吨位肯定比李定国打缅甸阿瓦城时重型得多——李定国当时是要翻越皎山陆路运炮的，所以只能用骑兵炮。
有了重型攻城臼炮，跟守方的要塞炮射程差距不大，所需挖的沃邦攻城法交通壕也就能省掉很多长度。稍稍挖了一两百步，就够臼炮射程了。
明军很快不遗余力地使用重型开花弹勐轰，西班牙守军也不甘示弱，用要塞岸防炮反击。可惜平直的岸防炮弹道大多打在了沃邦攻城壕的背侧斜面上，根本没什么效果。
明军把安防要塞的护墙轰出一个缺口后，就驱赶大量的土着俘虏上前，负责担土填壕。胆敢不上前者，就立刻在背后用排枪击毙——
而这些土着，当然都是被汉人指认的给西班牙人当走狗的部落的人，完全是报应。明军抓了他们后，倒也不急着屠部落，正好给他们一个机会将功赎罪废物利用。
西班牙人看着蜂拥上来破坏护城壕的土着，也只能疯狂开枪开炮还击，明军又在后面射程外拿火枪督促，一时阵地上死者枕藉。
最后，经过数日的破坏，巴丹要塞外面的护城壕几乎被土石和尸体填平，足足用了数千戴罪土着炮灰，明军硬生生趟出一条进攻坦途来，然后主力部队才在火力准备下一拥而上，冲上棱堡护墙跟西班牙军对射、拼刺刀肉搏。
连番血战厮杀，最终巴丹安防要塞内的两千西班牙守军，和五千余人的土着守军，全部被明军歼灭。
西班牙人在战死了六百多人后，剩下一千四百人里又有数百人受伤，居然就直接很没骨气地投降了。
土着军队则是被西班牙人作为炮灰使用的，经常顶在最前面危险的位置，所以伤亡更多一些，足足伤亡了两三千人，其他都被明军俘虏。
明军也不养闲人，直接给这些俘虏缴械了，发给一些扁担和沙包，让他们在后续战役中打先锋破坏城防设施。
然后明军又故技重施，花了不到半个月拿下科雷吉多岛。岛上约有西班牙士兵八百人，土着兵两千余人，同样被明军歼灭，残部崩溃投降。
前后一个月时间扫除全部外围障碍后，至此从林加延湾南岸到巴丹半岛，这一线以西的土地全部被大明占领，连成一片。也可以说马尼拉以西的吕宋岛土地，基本上都落入大明之手。
十二月上旬，郑成功略作休整，从中旬开始，终于推进到马尼拉城外，开始最后的攻坚准备。
西班牙人在吕宋的全部驻军不过六千五百人，两处重要地区被占领，还有其他一些外围城池丢失，马尼拉城内的西班牙白人士兵，也只剩三千七百人了。
曼努埃尔.阿吉雷总督无奈，只能孤注一掷，集中所有的单桅臼炮船，准备依托马尼拉城死守。
同时也派出联络船，让一直躲在外海巡游、试图断明军补给船队的拉蒙德.普拉多海军中将，带着菲律宾舰队回来支援决战。事到如今，已经不可能指望安防要塞消耗郑成功的舰队了，西班牙人的舰队再夺下去，就连老巢都没了。
是死是活只剩最后一把，要不就投降。