可是让肖天健没有想到的是在这个时候，南方还是出了麻烦，使得肖天健也顾不得陕西的和李自成的决战了，授命阎重喜和刘宝全权负责清剿李自成大顺军之事，并将手头北方的事务暂时交代给了卢象升和罗立等人之后，便立即开始南下，赶往了南京。
肖天健之所以忽然间放下清剿李自成之事飞速南下，其实原因很简单，就是八月间，南方诸省在得知京师被大中军所克，大明崇祯皇帝已经殉难，而且皇太子朱慈烺宣布禅位给肖天健，宣告从今以后再不谋登临天下，同时也宣告了大明王朝终亡。
南方诸省官府以及官军闻之立即大乱了起来，临近大中军控制区的江西、贵州、浙江等省随即便放弃了继续跟大中朝为敌，朝南京递降表宣布投降大中朝。
本来肖天健以为，南方的事情应该可以相对比较容易解决了，历史上的南明朝廷很可能不会再出现了，可是让肖天健没有料到的是最终事情并没有像他预料的那样发展。
福建、广东、广西以及云南四省却并未像他想象的那样轻易就放弃了抵抗，归服于大中朝的统治，相反在经过最初的慌乱之后，南方还是在明朝旧吏们的推举之下搞出了南明朝廷，以朱家皇室子嗣继承大明王朝的衣钵，宣布要继续和大中朝对抗下去。
不过让肖天健万没有想到的是，与历史上大为不同的是南方这一次居然同时出现了两个皇帝。
随着临时在南京主持政务的付德明和李进德的一封奏疏，肖天健这才在北京得知，先是广西巡抚翟式耜以及大学士丁魁楚以及两广总督朱治涧等人，在广东肇庆府拥立明神宗之孙朱由榔称帝，改元永历，宣称继承大明王朝，要行复明之举。
可笑的是就在朱由榔在肇庆府称帝的同时，福建巡抚张肯唐以及福建总兵郑芝龙却在福建漳州府，将唐王朱聿键之弟朱聿鐭扶了出来，在漳州府称帝，改元绍武。
这一下南方可就热闹了！小小的南方诸省，居然同时出现了两个皇帝，不管是自称永历皇帝的朱由榔，还是自称绍武皇帝的朱聿鐭，都宣称他们才能继承大统，是合法的大明皇帝，而且两方各自都因为自己的利益，都互相不承认对方的合法性。
于是这俩新登基的南明新皇，在登基之后，各自都组建了一个班底，分别设立了全套的官员，成立了他们的小朝廷。
这俩小朝廷成立之后，并没有立即集结兵力北上对大中控制区发动进攻，抑或是做好防守的准备，相反为了争夺这个名分，倒是两方相互之间，各自调动兵马，开始攻打起了对方。
这一下把大中朝这边给搞糊涂了，不管是付德明还是李进德，抑或是牛金星等大中朝的重臣，都为此面面相觑，又对此是哭笑不得。
于是以付德明为首的诸臣，赶忙将这件事写成奏章，派人八百里加急报送往了北京，肖天健这才在北京得知了消息。
这件事不是一件小事，肖天健最担心的并不是李自成的问题，说起来李自成在陕西蹦跶的挺欢，号称拥兵四十万，但是肖天健已经从田见秀那里了解到了李自成那四十万大顺军都是什么货色，所以有第一镇军和第二镇军配合入陕对李自成的大顺军进行进剿，以其现有的兵力和素质，干掉大顺军根本就不在话下。
但是肖天健最担心的却还是南方诸省的问题，要知道历史上清兵入关之后，南明在南方坚持了相当长的时间，特别是云南、广西、福建山林众多，而且少数民族也相当多，很不容易将其剿灭。
特别是郑氏集团，他们陆上战斗力虽然不强，但是却控制着大海的海路，其麾下的水师相当厉害，一旦福建不保，他们还可以退守台湾，历史上清朝收复台湾，就已经是康熙二十三年的事情了，那距现在已经是四十多年之后了！
四十多年呀！肖天健自己都没信心能活到那个时候，这四十多年对于中华来说，是何其宝贵的四十多年，等到四十多年之后，这世界各地早就被西方国家给瓜分的差不多了，中华到那个时候再进入大海，黄瓜菜都凉了！
（这些天为了准备新书，搞得失眠头疼，有时候想干脆也去写玄幻拉倒，写历史类的太累了！一不小心还出力不讨好，但是仔细想想，却又舍不得看书的弟兄们！今天要特别鸣谢风沐春江老朋友的打赏，为这个月又开了一个好头！谢谢！）