同时丁启睿还派监军万元吉坐镇庐州府督军抵御河南刘宝一支刑天军对南直隶的攻势，至此整个南方的官军，已经彻底失去了主动进攻的能力，只能采取被动的防守的方式，来阻止刑天军对南直隶的威胁。
肖天健在武昌府之中，不断的观察着麾下各部的行动，盘算着下一步的行动，通过在打下武昌府之后的十、十一月这两个月的休整和物资补充、重新编练之后，肖天健单在武昌府周边，便陈兵两万余人，这两万余人，都暂编到了近卫集团之中，编列成为了近十个战兵营和骑兵营，其中甲种营三个、乙种营三个，丙种营两个，外加骑兵营两个，另外还有三个水营、两个重炮营，两个辎兵营，一个工兵营，基本上各营都已经齐装满员，这还不包括罗立的二师的一万多人马和刘耀本所率的五千多近卫师的人马，当然也不能算上李信时下在湖广南部和江西西南部统驭的两万多人马。
而在肖天健眼下的手下则集齐了罗汝才、司徒亮、石冉、林洛、老回回等数十员战将，可谓是兵强马壮，士饱马腾。
现在如果还将近卫师称为师的话，那么这个师也实在有点太大了点了，其实到了这会儿，近卫师已经可以称作是一个兵团了，这么庞大的兵力，为了指挥方便，肖天健于是将其临时划分成了三个师，除了水营和重炮营以及铁头的近卫营单列之外，其余的十几个营肖天健将其分为三个近卫师，刘耀本充当第一近卫师都统、司徒亮担纲第二近卫师都统，老回回则充当第三近卫师的都统，石冉和林洛二人则直接归肖天健，算是肖天健直领总部的人员，石冉挂都统衔，而林洛则暂挂代副都统的职衔。
而且经过连续两个月的补充和高强度的整训之后，各部的兵马现在都可以说有了脱胎换骨的改变，这些新营之中大部分都是新兵，在淘汰裁撤掉其中部分不合格的兵将，并且严加整肃，又以砍脑袋的方式杀了一些顶风作案、以身试法的军中败类，同时又以嘉奖和拔擢等方式，提拔起来了一批军将，在这样胡萝卜加大棒的严训之下，这些新编的诸营兵将们的风貌也发生了很大的改变，谁都体会到了刑天军的军法无情，知道刑天军的军法不是说说闹着玩儿的了，而且高强度的操练，使得他们很快适应了新的作战战术和方式，整体上的战斗力在这两个月的时间里，都提升了很多。
即便是最差的丙种营，也不甘人后，虽然装备差一点，但是士气却并不差，一个个兵将们都卯足劲，要将他们的丙种营的分类给抹掉，提升为甲种营，最差也要改成乙种营，所以练兵的时候，军官更是严苛，兵卒们也很是卖力，所以他们居然给超过他们的甲乙两类的战兵营也造成了不小的压力，谁也不想今后被贬成丙种营，所以相互之间暗中较劲，在驻地掀起了练兵的热潮。
就连一些新兵以前是吊儿郎当的官兵，在入了刑天军之后，也都收起了他们的散漫，渐渐的适应了这种生活，开始变得士气昂扬了起来，以前在官军之中养成的那些坏毛病，也都尽可能的收敛了起来，不敢再犯了。
总之到了十二月的时候，肖天健亲自在武昌城外召集起了这些兵马，来了一次大规模的演习，他将两个师分为红兰两军，进行了一次大规模的近似于实战的对抗演练，除了演练野战之外，还以武昌县城为演习场地，演练了攻城和守城的战术。
虽然整训时间只有两个多月，但是诸部都展现出了昂扬的斗志，可惜的是这些新营成军时间还是稍短了一些，在很多战术上还没有成熟，在对抗演习之中，闹出不少的纰漏，让肖天健多少有点不太满意，但是回想一下刑天军的成军史，其余的那些旧部主力，岂不是也都是在历次的战斗之中逐步的锤炼出来的吗？想要两个多月时间，便将这些新营都锤炼的跟那些老部下们一般，显然是有点太过难为他们了，真正的一支精锐兵马，是要通过反复不断的上阵，才能锤炼出来的，这一点肖天健还是很清楚的，没有个一年多的时间，打上几次大仗，就想让这些新营都成为真正的精锐，是不可能的，现在能做到这一步，可以说军中的那些军将们已经做了最大的努力了。
假以时日肖天健相信，这些新编组成的兵马，也都会成为真正的精兵，最起码现在他已经将刑天军的烙印，深深的烙在了他们的身上，就不愁他们以后不能成为精兵，更何况了，构架起这些新营的军将骨干还是他从各处抽调的老部下们，只要有他们在，就不会有什么大问题。
这一点单是看看老回回带出来的那些旧部们，就能看出来，第一次见到老回回和他的手下的时候，这帮人要么就是落魄不堪，要么就是骄兵悍将七个不服八个不忿的，谁都放不到他们眼里，可是通过这近一年的锤炼之后，他们也都融入到了刑天军之中，开始变得和其它肖天健的旧部没什么两样了，各个脸上都洋溢着一种骄傲的神态，这也只有刑天军才能做到这一点。
除了这些步军进行了演练之外，包括水鸭子张弛和刘江他们率领的水营，也在江面上进行了一场对抗性的演练，两个战船营之间演练了水上的对攻以及掩护等等战术，而那个专司转运物资人马的货船营，也在码头上演练了装卸人员马匹和物资，总体上战斗力也提升了一大截，起码不像以前在来武昌之前的时候，在江面上乱哄哄的一片了，数百条各式船只，单是整整齐齐的在江面上列阵，高高的桅杆悬挂满了各种认旗军旗，就让人看的是心驰神摇，连连感叹了。
所以不要看他们只有区区两万余人，可是肖天健相信他们所能发挥出来的战斗力要远超过数倍于他们的官军，再加上罗立和刘耀本的旧部，在刘宝所部的配合下，打南直隶已经条件基本上成熟了。
于是肖天健在这个时候，拿定了主意，再加紧进行训练一个月之后，年后择机便开始顺江而下，兵发南京城。